Nascido em Milão, Giovanni Antonini estudou música em sua cidade natal e em Genebra. Em 1985, cofundou o conjunto barroco Il Giardino Armonico, que passou a dirigir e com o qual gravou obras de Vivaldi e repertório dos séculos XVI e XVII.
Também atua como maestro convidado de orquestras e óperas. Desde 2014, conduz o projeto Haydn2032, que prevê a gravação e execução das sinfonias de Joseph Haydn até 2032.
